Análisis de péptidos del virus de la Hepatitis C según su capacidad de estimular células T citotóxicas / Ibel Carri.

Por: Carri, IbelTipo de material: TextoTextoIdioma: Español Detalles de publicación: Gualeguaychú : Universidad de Concepción del Uruguay CRG, 2016Edición: 1a edDescripción: 53 h. : 30 x 21 cmTema(s): TESINA | HEMOTERAPIA E INMUNOHEMATOLOGIA | INMUNOGENICIDAD | REACTIVIDAD CRUZADA | COMPLEJO MAYOR DE HISTOCOMPATIBILIDAD TIPO I | VIA ENDOGENA DE PROCESAMIENTO Y PRESENTACION
Contenidos:
Agradecimientos. Lista de símbolos. 1. Resumen. 2. Introducción. 3. Justificación /Fundamentación.4. Objetivos: 4.1 objetivo general. 4.2 Objetivos específicos. 5. Planteamiento del problema.: 5.1 Preguntas de investigación. 5.2 Hipótesis. 6. Marco de referencia: 6.1 Inmunología. 6.1.1 Procesamiento antigénico. 6.2 Virus 6.2.1 Virus de la Hepatitis C. 6.3 Microbioma. 6.4 Bioinformática 6.4.1 Inmunoinformática. 6.4.2Redes neuronales artificiales. 6.5 Antecedentes. 7 Materiales y métodos. 7.1 Recolección de información empírica. 7.2 Selección de péptidos de VHC. 7.3 Predicción de la afinindad de los péptidos a moléculas del CMH tipo I. 7.4 Predicción de clivaje por proteasoma. 7.5 Cálculo de eficiencia del transporte intracelular mediado por TAP. 7.6 Predicción de la estabilidad del complejo péptidos CMH 7.7 Selección de secuencias péptidas del microbioma y del proteoma humano. 7.8 Cálculo de similitud entre péptidos de VCH y péptidos de microbioma y proteoma humanos. 7.9 Análisis estadísticos. 8. Resultados. 8.1. Péptidos del VHC seleccionados. 8.2 Afinidad a CMH. 8.3 Clivaje de proteasoma 8.4 Eficiencia del transporte intracelular TAP. 8.5 Estabilidad del complejo péptido CMH. 8.6 Similitud de VHC con microbioma y proteínas humanas. 8.7 Modelo de regresión lineal múltiple. 8.8 Discusión. 9. Conclusión. 10. Comentarios sobre el desarrollo. 10.1 Bibliografía de consulta. Referencias bibliográficas. Anexo: Matriz BLOSUM 50. Anexo Matriz de valores de unión TAP. Glosario.
Resumen: La eliminación del virus de la Hepatitis C (VHC) está asociada a la acción sostenida de linfocitos T citotóxicos CD8+(CTL) sobre las células infectadas. [Thomas et al., 2005] En el presente trabajo se buscó detectar cuáles son las características de los péptidos de VHC que impactan en el reconocimiento por CTL y determinan su inmunogenicidad. Para ello se analizó el clivaje de proteasoma, la eficiencia de transporte intracelular asociado a TAP, la afinidad a moléculas del Complejo Mayor de Histocompatibilidad tipo I (CMH) la estabilidad del complejo y la similitud con patrones moleculares del proteoma humano y del microbioma utilizando técnicas computacionales. Se observó que estos factores aisladamente no determinan significativamente la inmunogenicidad de péptidos de VHC.
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Agradecimientos. Lista de símbolos. 1. Resumen. 2. Introducción. 3. Justificación /Fundamentación.4. Objetivos: 4.1 objetivo general. 4.2 Objetivos específicos. 5. Planteamiento del problema.: 5.1 Preguntas de investigación. 5.2 Hipótesis. 6. Marco de referencia: 6.1 Inmunología. 6.1.1 Procesamiento antigénico. 6.2 Virus 6.2.1 Virus de la Hepatitis C. 6.3 Microbioma. 6.4 Bioinformática 6.4.1 Inmunoinformática. 6.4.2Redes neuronales artificiales. 6.5 Antecedentes. 7 Materiales y métodos. 7.1 Recolección de información empírica. 7.2 Selección de péptidos de VHC. 7.3 Predicción de la afinindad de los péptidos a moléculas del CMH tipo I. 7.4 Predicción de clivaje por proteasoma. 7.5 Cálculo de eficiencia del transporte intracelular mediado por TAP. 7.6 Predicción de la estabilidad del complejo péptidos CMH 7.7 Selección de secuencias péptidas del microbioma y del proteoma humano. 7.8 Cálculo de similitud entre péptidos de VCH y péptidos de microbioma y proteoma humanos. 7.9 Análisis estadísticos. 8. Resultados. 8.1. Péptidos del VHC seleccionados. 8.2 Afinidad a CMH. 8.3 Clivaje de proteasoma 8.4 Eficiencia del transporte intracelular TAP. 8.5 Estabilidad del complejo péptido CMH. 8.6 Similitud de VHC con microbioma y proteínas humanas. 8.7 Modelo de regresión lineal múltiple. 8.8 Discusión. 9. Conclusión. 10. Comentarios sobre el desarrollo. 10.1 Bibliografía de consulta. Referencias bibliográficas. Anexo: Matriz BLOSUM 50. Anexo Matriz de valores de unión TAP. Glosario.

La eliminación del virus de la Hepatitis C (VHC) está asociada a la acción sostenida de linfocitos T citotóxicos CD8+(CTL) sobre las células infectadas. [Thomas et al., 2005] En el presente trabajo se buscó detectar cuáles son las características de los péptidos de VHC que impactan en el reconocimiento por CTL y determinan su inmunogenicidad. Para ello se analizó el clivaje de proteasoma, la eficiencia de transporte intracelular asociado a TAP, la afinidad a moléculas del Complejo Mayor de Histocompatibilidad tipo I (CMH) la estabilidad del complejo y la similitud con patrones moleculares del proteoma humano y del microbioma utilizando técnicas computacionales. Se observó que estos factores aisladamente no determinan significativamente la inmunogenicidad de péptidos de VHC.

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